L’INSPQ dispose d’une base de données substantielle qui comprend des données de vigie génomique du SRAS-CoV-2 provenant d’échantillons cliniques de toute la province et d’échantillons d’eaux usées collectées en milieu urbain (Station de traitement d’eau usée de Québec et Montréal) et en établissement (Aéroport de Montréal).
Étant donné que les méthodes de séquençage et d’échantillonnage des eaux usées doivent être adaptées au lieu de collecte et aux capacités de séquençage des laboratoires participants, plusieurs étapes préparatoires ont été réalisées pour établir la méthode de collecte et d’analyse appropriée pour la province de Québec. Bien que les analyses préliminaires aient montré une certaine cohérence entre les lignées du SRAS-CoV-2 détectées par les deux types d’échantillons, les résultats du séquençage dans les eaux usées sont restés préliminaires et n’ont été partagés qu’à l’interne de l’INSPQ.
Même si la vigie du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées est actuellement cessée, une analyse comparative des données génomiques historiques pourrait permettre de documenter leur utilité et de mieux évaluer leur potentiel pour la vigie épidémiologique.

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