Doctoral Researcher Bioinformatics Avian virology

at  Sciensano

Bedrijf
Sciensano verbindt gezondheid, wetenschap en samenleving en telt meer dan 900 medewerkers die zich elke dag opnieuw inzetten voor de gezondheid van mens en dier. Zoals uit onze naam blijkt, vormen wetenschap en gezondheid de kern van ons bestaan. De kracht van Sciensano ligt in de holistische en multidisciplinaire benadering van gezondheid. Onze aandacht gaat daarbij uit naar het nauwe en onlosmakelijke verband tussen de gezondheid van mensen en die van dieren, en hun omgeving (het “One health” concept). Daarom combineren we meerdere invalshoeken in ons onderzoek om op een unieke manier bij te dragen aan ieders gezondheid. Sciensano kan hiervoor verder bouwen op de meer dan 100 jaar wetenschappelijke expertise van het voormalige Centrum voor Onderzoek in Diergeneeskunde en Agrochemie (CODA) en het vroegere Wetenschappelijk Instituut Volksgezondheid (WIV). Voor meer informatie over onze projecten en activiteiten : https://www.sciensano.be.
Functiebeschrijving
Je werkt als bursaal student op de afdeling Aviaire Virologie en Immunologie, binnen het Wetenschappelijk Directoraat Dierlijke Infectieziekten. Je werkt meer specifiek in het laboratorium voor aviaire virologie (Nationaal Referentielaboratorium voor aviaire influenza en de ziekte van Newcastle).
Je komt terecht in een team van wetenschappers met meer dan 10 jaar ervaring in de toepassing van Next Generation Sequencing-technologieën voor de karakterisering van veevirussen. We werken nauw samen met sterke virologie- en immunologieteams en ontwikkelen robuuste in vivo, in vitro en ex vivo experimentele systemen voor het onderzoeken van infectieziekten bij pluimveesoorten.

Je zult het volgende uitvoeren:

• Systematisch literatuuronderzoek om beslissingen voor de ontwikkeling van workflows goed in te kaderen
• De ontwikkeling van RNASeq workflows voor de karakterisering van de gastheerrespons van vogels (kippen en andere vogelsoorten) op virusinfecties (hoogpathogene aviaire influenza) (transcriptomics). Je focus zal in het bijzonder liggen op de ontwikkeling van data analyse workflows die complexe vergelijkende analyses van transcriptomics data van niet-model organismen mogelijk maken.
• Communicatie van je bevindingen in rapporten, wetenschappelijke publicaties en presentaties.

HPAI-virussen vormen een groot probleem voor de dier- en volksgezondheid. De resultaten van dit proefschrift zullen zorgen voor een beter begrip van de interactie tussen deze virussen en hun aviaire gastheren.

Please refer the Job description for details